日本水果的产量相对较低
日本是一个四面环海的国家，国土面积的70%以上都是山地，可用的耕地面积十分有限。加之气候较为复杂，因此水果的总产量相对比较低。
日本的水果产量在昭和30至40年代（1955~1974年）大幅度增加，甚至1979年达到685万吨，但由于生产过剩及价格暴跌等原因，日本政府采取了产量控制等相关措施，近年来的产量一直在低于300万吨左右。之后，通过高品质化的相关措施，日本水果的生产总额逐年不断上升，近年来约为8400亿日元（约合人民币560亿元）。
所谓“物以稀为贵”，产量低，价格自然就会偏高。
虽然产量低，不过日本每个地区有每个地区的特色，打造出了不少世界闻名的水果品牌，比如山梨县的葡萄、青森县的苹果、北海道的密瓜等等。
日本水果的生产成本较高
日本的高质量水果的生产，还需在每个农田彻底进行水分及压力管理、为每一个果实撑小伞、在复杂地形上均匀铺设覆盖料等，这些工作需要高度的技术，且无法推进机械化，并且大多数农田都处在陡峭的半山腰，因此只能由水果生产者费时费力，靠手工来支撑起这个产业。
由此可见，水果生产是劳动密集型的结构，与大米等土地利用性农产品相比，劳动时间长，农业用地的集积和集中以及规模扩张也没有取得进展，因此规模经济的优势不起作用，劳动生产率低，导致生产成本仍然保持高水准。
比如种植葡萄，对于作物之间的间距、架子的高矮，生长过程中的长势等都有严格的要求。虽然会增加成本，但也能降低病害的发生，让成熟的果粒大小均匀，糖度提高等等。
水果在日本的“身份”不同
由于上述原因，就有了“在日本水果与其他国家相比偏贵”这一说法。不过除此之外还有一个重要原因，那就是日本水果的“身份”不同，即私人消费的水果与赠礼品的水果的区别。
在日本，水果曾经是奢侈品，其用途几乎仅限于赠礼品，从江户时代开始，水果就是作为甜品来食用的，通常是料理的最后一道，比较常见的有桃、密瓜、葡萄、梨等等，一般都是应季的水果，经过严格的筛选和制作之后才能上桌，是“高级”的象征。现如今，大部分水果价格都是私人消费能够接受的价格范围内，但日本依然保存着作为礼品为重要的人赠送水果的文化。这就是日本水果的“另一个身份”。
用于赠礼品的是高级水果。这些高级水果都是农家特别费时费力生产出来的，有些已经品牌化了，虽说销售价格比较高，但一直以来是日本人互赠礼品的最佳选择之一，在中元节和年终岁末赠送水果已经演化成了一种文化现象。
然而，近年来，除了赠礼品以外，有人还会为了奖励自己而购买高级水果。可见，随着消费者喜好的多样化，高级水果的用途也越来越多了~
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